中国学者最新研究:新型冠状病毒的直接来源最可能是蛇

澎湃新闻记者 吴跃伟 廖艳

2020-01-23 09:43 来源:澎湃新闻

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已有的流行病学证据和生物信息学分析显示,造成2003年SARS疫情的直接来源是野生动物市场上的果子狸。中华菊头蝠则是SARS病毒的源头。
1月22日,中国学者最新在线发表的一篇研究论文将导致17人死亡、500多人确诊感染的2019-nCoV新型冠状病毒肺炎疫情的可疑对象锁定到蛇。
该论文的标题是《新型冠状病毒纤突蛋白的同源重组可能促进了从蛇到人的跨物种传播》,由北京大学、广西中医药大学、宁波大学、武汉生物工程学院的研究人员联合完成,22日在线发表在英文学术期刊《医学病毒学杂志》(Journal of Medical Virology)。
这也是发现新型冠状病毒并测序后第15天,中国学者发表的第二篇关于该病毒的研究论文。
该论文称,研究人员对前述冠状病毒的基因序列进行了分析,评估这些序列中的RSCU。然后将前述冠状病毒的RSCU与不同物种动物基因序列的RSCU进行比较。
前述论文称,研究结果显示,与其他动物相比,蛇最有可能是携带前述新型冠状病毒的动物。
该论文称,RSCU分析使用了Bungarus multicinctus(银环蛇)和Naja Atra(中华眼镜蛇)。新型冠状病毒与前述两种蛇的“平方欧氏距离”(Squared eu-clidean distance)都小于14,但与蝙蝠的“平方欧氏距离”是27.47。“这些数据表明,与其他动物相比,新型冠状病毒2019-nCoV能更有效地使用蛇的翻译机制,也意味着新型冠状病毒的流行可能源自蛇。”蛇是野生动物中蓄留前述冠状病毒的最可能的“水库”。
该论文表示,前述两种蛇要么在中国中部和南部有自然分布,要么在武汉市华南海鲜城有销售。蛇是冷血动物,温度比人类低,因此,当感染人类时,新型冠状病毒可能会减弱。但是人们担心它的适应性。
RSCU的全称是“同义密码子相对使用度”(或使用频率、使用偏倚,relative synonymous codon usage)。它是指同一基因序列在编码某一个氨基酸时,对同义密码子使用的偏好(偏倚)程度。
三个相邻的核苷酸可能用于编码一个氨基酸,这样的三个核苷酸被称为密码子。当它们出现不同排列组合却编码同一氨基酸时,它们被称为同义密码子。
不同物种对前述排列组合的偏好程度有差异。也就是说,这些排列组合在不同物种中出现的频率有差异。这种对比分析方法被用于分析病毒的进化、重组,即RSCU方法。
此外,前述论文称,新型冠状病毒是一种重组病毒,病毒的重组区域位于病毒的纤突蛋白。该蛋白如同一把工具,用于识别宿主细胞的表面受体,撬开细胞的防护之门。新型冠状病毒的部分基因序列来自蝙蝠冠状病毒。
23天前,2019年12月30日,湖北省武汉市聚集性不明原因病毒性肺炎的消息传出。疫情最早发生地为武汉华南海鲜城,海鲜城内实际存在大量野味交易。
2020年1月7日,病原体初步判定为新型冠状病毒,经测序,获得其全基因组序列。随后,在网上公布。这是一种RNA单链病毒。
1月20日晚间,国家卫健委高级别专家组组长、中国工程院院士钟南山在接受采访时表示,根据流行病学分析,此次新型冠状病毒来源很大可能是野生动物,比如竹鼠、獾等。
22日上午,中国科学院院士、中国疾病预防控制中心主任高福在国务院新闻办新闻发布会上表示,前述新型冠状病毒的来源是武汉当地一家海鲜市场非法销售的野生动物。
22日上午,北京大学保护生物学教授、自然保护与社会发展研究中心执行主任吕植公开发布建议称,呼吁国家林草局和各地野生动物主管部门及执法部门负起责任,主动作为,及时行动。她表示,吃野味是陋习,事关公共安全。
1月21日11:49,中国科学院和国家自然科学基金委员会共同主办的英文学术期刊《中国科学》的微信公众号发布消息称,中国学者发表最新研究论文,通过模拟计算病毒s蛋白的结构,分析了武汉新型冠状病毒的进化来源。该论文称,如同导致2002年“非典”的SARS冠状病毒一样,武汉新型冠状病毒的自然宿主也可能是蝙蝠,而且,从蝙蝠到人的传染过程中很可能存在未知的中间宿主媒介。这一研究成果预测了武汉冠状病毒有很强的对人感染能力。
前述消息称,这一研究成果,是在国家“重大新药创制”科技重大专项的支持下(应急医学药物新品种研发及其关键创新技术体系)完成的。
据悉,这是第一篇关于新型冠状病毒的研究论文。
该论文由中国科学院上海巴斯德研究所郝沛研究员、军事医学研究院国家应急防控药物工程技术研究中心钟武研究员和中科院分子植物卓越中心合成生物学重点实验室李轩研究员合作完成。
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责任编辑:李敏
校对:刘威
澎湃新闻报料:4009-20-4009   澎湃新闻,未经授权不得转载
关键词 >> 新型冠状病毒 蛇 肺炎

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