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讨论加州保护基因组学项目(CCGP)最新进展|4月22日VGP/EBP会议

2022-04-21 18:47
来源:澎湃新闻·澎湃号·政务
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2022年4月20日,中国生物多样性保护与绿色发展基金会(简称中国绿发会、绿会)国际部收到所在的国际大科学计划“地球生物基因组计划”(EBP)的最新通知:下一次VGP/EBP会议将于本周五(也就是4月22日晚上)举办。作为EBP全球44家成员机构之一,绿会国际部代表将参加此次会议。为深度参与全球数字治理、创建世界一流学会,绿会国际部将其编译分享如下。

 

上图:地球生物基因组计划(EBP)。来源/EBP

本周五的VGP/EBP会议将由Brad Shaffer和Merly Escalona主持,他们将介绍加州保护基因组学项目(CCGP)的最新进展。

 

上图:加州保护基因组学项目(CCGP)。来源/CCGP

加州保护基因组学项目(CCGP),是由加利福尼亚州资助,由加州大学洛杉矶分校(UCLA)/洛杉矶克雷茨加州保护科学中心(La Kretz Center for California Conservation Science)领导,已经有包括来自所有10个加州大学校园的科学家参与其中。 

 

上图:脊椎动物基因组计划(VGP)介绍。来源/VGP

 

上图:脊椎动物基因组计划(VGP)开创了基因组测序的新纪元。在2021年4月28日《自然》特刊中关于所有现存脊椎动物物种的报道中赞美:“VGP报告了它的第一个发现,即生成几乎无错误的(error-free)……”。来源/VGP

脊椎动物基因组计划(VGP),是基因组10k计划(G10k)的一个项目,旨在生成约70,000种地球上现存脊椎动物的高质量、近零差错率、没有空缺的参考基因组组合。这些基因组将被用于解决生物学和疾病中的基本问题,识别最具灭绝风险的物种,并保存生命的遗传信息。VGP的动机部分基于G10K,即生成10,000种或更多脊椎动物的基因组,以及从鸟类系统基因组学项目中吸取的经验教训。VGP将基于分类层次结构完成,这是一组生物的相对排名,从最大分类、领域开始,到最小分类、物种:目(第1阶段)、科(第2阶段)和属(第3阶段),最终到所有物种(第4阶段)。这一战略将使我们能够在每个阶段获得科学见解,继续整合新兴技术,并在越来越高的系统发育水平上完成基因组分析。

地球生物基因组计划,全称是Earth BioGenome Project(EBP),是继人类基因组计划后又一个大型国际计划。其目标是在10年内,对约150万种已知真核生物进行测序和序列注释。该计划由加州大学戴维斯分校的科学家于2017年2月发出倡议,获得了中国、美国、英国、挪威、巴西等多个国家的科学家积极响应。EBP的三个目标,分别是:造福人类、保护生物多样性、了解生态系统。

【绿讯】是中国绿发会国际部发挥智库功能、为了推动中国深度参与全球环境治理推出的一系列全球环境治理的最新的动态。译文仅供参考。

编译/Littlejane 审/绿茵 责编/angel

【拓展阅读】

1. 大年初四,绿会代表参加地球生物基因组计划(EBP)2022年2月例会(2022-02-04)

2. 「绿讯」地球生物基因组计划召开学术交流会议:极低起始量测序(2022-01-21)

3. 中国绿发会加入EBP,成为第二位中国学术成员(2021-10-20)

4. Arang Rhie et al. "Towards complete and error-free genome assemblies of all vertebrate species." Nature. Published online April 28, 2021. doi: 10.1038/s41586-021-03451-0

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