华大基因:2020年前个人全基因组测序价降至三百美元以内

澎湃新闻记者 贺梨萍

2018-01-11 17:21 来源:澎湃新闻

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北京时间1月11日凌晨,中国基因测序界龙头华大基因(300676)CEO尹烨在于美国旧金山举办的第36届J.P.Morgan健康大会(J.P.Morgan Healthcare Conference)上发布了公司的两项重大计划,“2020计划”及“生命周期表计划”。
据华大基因方面介绍,“2020计划”指的是,在2020年以前,华大基因有望在24小时内完成一个人全基因组样本制备、测序和数据分析等所有内容,并将价格控制在300美元以内。这也就意味着,未来个人全基因组测序价格将降至目前最低价的一半。
个人全基因组测序(Whole Genome Sequencing,WGS)是目前大规模获得人高质量基因序列信息的主要手段,利用高通量测序技术对人类不同个体或群体进行全基因测序并进行生物信息分析。海量的数据将被用于评估个人健康和疾病,被认为是精准医学的第一步。
对于速度更快、成本更低这两项目标而言,包括华大基因在内的公司都在不断追求。历史数据显示,2001年,由美国、英国、法国、德国、日本和中国6个国家超过3000名科学家共同参与的第一个人类基因组草图绘制完成,耗时13年,所用总资金超过30亿美元。2007年,第一个中国人的基因组则耗时数月、耗费300万美金完成。
尹烨在演讲中指出,华大基因在2015年底推出的自主测序平台BGISEQ-500,“以600美元的低价引领个人全基因组测序进入百元美金时代”。目前,个人全基因组测序的最低费用即为600美元,该记录由华大基因于2016年创造并保持至今。
尹烨在此番发言中公布了最新数据,华大基因已经交付个人全基因组测序超过1万例,并且还有超过2万例的样本正在执行中。
值得一提的是,在数据分析方面,就在此前的1月5日,华大基因计算平台云BGI Online和美国Edico Genome公司合作,仅用120分钟完成了100个人全基因组的数据分析。华大基因在2014年启动BGI Online项目,并于2015年引入阿里云、英特尔联手打造。
在此之前,使用普通高性能计算集群进行单个样本的个人全基因组分析,通常需要70小时以上。如果同时运行100个样本,则需要大量的计算资源或冗长的周期才能完成。
尹烨在J.P.Morgan健康大会同时发布的还有“生命周期表计划”。该计划旨在通过基因测序对物种进行数据挖掘,发现隐藏在数据背后的生命规律,最终实现“数字化动植物,数字化地球”的宏伟目标。
据了解,目前全球已测序的高等动植物中(含未公布)70%由华大基因和合作者共同完成。“生命周期表计划”第一期测序对象为现存27目157科的哺乳纲,已有超过127科物种被“科长”认领。“科长”将通过众筹的方式,推动该科物种的基因组分析、解读和知识传播。此外,“生命周期表计划”的植物部分也即将开启。
“生命周期表计划”的开展,其意义并不亚于“元素周期表”。尹烨如此评价公司的该项计划。
J.P.Morgan健康大会始于1983年,迄今已举办35年,是医疗产业内最富盛名的投资大会,通常被认为是当年医药产业运作的起始。
责任编辑:张赛男澎湃新闻报料:4009-20-4009   澎湃新闻,未经授权不得转载
关键词 >> 华大基因,个人全基因组测序,澎湃

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