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国家基因库成GISAID中国首个授权机构,助病毒数据共享

澎湃新闻记者 贺梨萍
2020-03-16 16:37
来源:澎湃新闻
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澎湃新闻记者从国内基因测序龙头华大集团处获悉,3月16日,深圳国家基因库(下称“国家基因库”)与全球共享流感数据倡议组织(GISAID)达成战略性合作,国家基因库生命大数据平台(CNGBdb)成为GISAID的中国首个正式授权平台。

华大方面称,本次战略合作将帮助中国科研工作者获得一站式病毒数据资源访问服务和更加丰富的分析工具,也标志着我国科研机构在合规合法、保护数据生产者和提交者权利的前提下,促进全球范围新型冠状病毒及流感数据共享方面迈出重要一步。

华大方面表示,为共同助力全球呼吸道传染病相关病毒研究,国家基因库与GISAID达成战略性合作,双方将围绕呼吸道传染病相关病毒的基因数据管理、共享、分析等方面展开全面合作,促进病毒数据的全球共享。

GISAID是目前全球最大的流感及新型冠状病毒数据平台,总部位于德国慕尼黑,于2008年5月第61届世界卫生大会期间启动,是由全世界一组权威的医学科学家组建,该组织致力于改善流感数据的共享。

GISAID的数据来源于全球14000名研究人员和1500个机构,其独特的数据共享机制可以促进相关研究取得快速进展,例如推动对COVID-19的认知和相关医疗对策的研发。GISAID针对新型冠状病毒开发的EpiCoV™数据库,目前已收录656条新型冠状病毒序列数据(截至3月13日),已超越传统的数据平台。

同时,传统数据平台(比如公有领域的数据库)因允许匿名访问而导致数据所有者权益不受保护、数据使用不透明的问题,这些在GISAID的数据共享机制中并不存在。

国家基因库是中国首个国家级综合性基因库,也是国家重大科技基础设施之一。2011年由国家发展改革委员会、财政部、工业和信息化部、卫生健康委员会(原卫生部)四部委批复建设,并在以国家发展改革委员会和深圳市政府为联合理事长单位的理事会指导下,由深圳华大生命科学研究院(原深圳华大基因研究院)组建及运营。

作为国内最大的生物大数据中心之一,国家基因库生命大数据平台汇集了国家基因库及全球其他重要数据源的公开数据,在本次新型冠状病毒疫情中,该平台已经汇总了国家基因库归档及NCBI的病毒序列数据资源159条(截至3月13日),助力研究人员快速发现、检索和分析病毒。

华大方面称,CNGBdb作为GISAID正式授权平台,秉承GISAID数据共享理念,维护数据生产者和数据提交者的权利,为国内科技成果发布搭建便捷通道,并与GISAID共同推进全球病毒基因组序列和相关信息资源可信共享机制的建设。

    责任编辑:李跃群
    图片编辑:施佳慧
    澎湃新闻报料:021-962866
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